Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms