Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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