Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF4BQ13523 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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