Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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