Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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