Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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TRAF1Q13077 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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TRAF1Q13077 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
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