Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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