Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2AQ12879 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms