Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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