Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms