Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms