Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms