Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLEQ07864 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms