Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms