Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms