Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR4Q05215 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms