Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms