Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms