Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms