Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OC90Q02509 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms