Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms