Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms