Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
XPCQ01831 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XPCQ01831 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPCQ01831 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPCQ01831 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms