Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms