Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms