Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms