Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms