Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms