Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms