Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX10P56693 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX10P56693 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX10P56693 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX10P56693 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX10P56693 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms