Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms