Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms