Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIP4K2AP48426 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIP4K2AP48426 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms