Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IQGAP1P46940 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms