Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms