Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP5P45974 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP5P45974 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP5P45974 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP5P45974 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP5P45974 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP5P45974 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP5P45974 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms