Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL35P42766 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL35P42766 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms