Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms