Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5C1P36542 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms