Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFNP31947 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFNP31947 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFNP31947 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFNP31947 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFNP31947 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFNP31947 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFNP31947 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms