Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms