Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA1P25786 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms