Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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