Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2CP19387 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2CP19387 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms