Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA6P17658 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms