Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA1P17302 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA1P17302 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJA1P17302 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJA1P17302 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJA1P17302 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJA1P17302 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJA1P17302 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA1P17302 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA1P17302 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA1P17302 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms