Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms