Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT13P13646 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT13P13646 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT13P13646 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT13P13646 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT13P13646 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT13P13646 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT13P13646 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms