Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3P10147 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3P10147 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3P10147 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3P10147 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3P10147 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms