Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms